"精实案"全部完成后，台湾海军的作战舰队和艇队将主要由装备更先进武器的二代舰艇所组成，包括2个驱逐舰队（124和146舰队）和2个巡防（护卫舰）舰队（131和168舰队），1个两栖登陆舰队，1个潜艇舰队，1个水雷舰队，1个勤务舰队，海蛟大队（快艇大队），海峰大队（岸基导弹大队），航空指挥部（包括 1个反潜直升机大队，1个反潜巡逻机大队），，3个海军陆战队旅（联兵旅，基干旅和守备旅），另有两栖登陆和侦搜大队和1个陆战轻型航空队，总兵力约5.6万人，其实力将大为增强。

台湾海军的基地和主要船坞分别设在左营、高雄、马公、基隆和苏澳（中正基地）等地。其中海军第一司令部设在左营；海军第二司令部和第154快速攻击中队设在马公（辖澎湖列岛、金门和乌丘）；海军第三司令部和131巡逻中队设在基隆（辖台北和马祖战斗群）；东海岸指挥部、潜艇补给站和船坞基地设在苏澳中正基地。此外，在花莲、大浊水、新竹、乌奇设有小型基地。■